Zgodnie z RBMP osiągnięcie dobrego stanu ekologicznego wszystkich europejskich akwenów powinno nastąpić do 2015 roku poprzez praktyczne zastosowanie planów zagospodarowania wody w dorzeczach harmonizacji praktyk zarządzania zasobami wodnymi w krajach regionu.
Stwierdzono, ze w społeczeństwie powszechnie brakuje zrozumienia znaczenia ochrony zasobów wodnych a dodatkowo ograniczona jest dostępności środków umożliwiających finansowanie inwestycji. Ponadto, często, zaproponowane rozwiązania, w wielu przypadkach nie są ani opłacalne ekonomicznie ani nie przynoszą spodziewanych efektów ekologicznych, a co więcej często są odrzucone na szczeblu lokalnym.
Pojawia się również wiele nowych wyzwań; w życie wchodzą nowe dyrektywy UE dotyczące gospodarki wodnej, które wymagają podjęcia natychmiastowych działań w celu zapewnienia jakości i trwałości zasobów wodnych w regionie Morza Bałtyckiego.
